Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trmt112Q9DCG9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trmt112Q9DCG9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms