Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf6Q9DBU5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf6Q9DBU5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms