Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc97Q9DBT3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc97Q9DBT3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms