Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAX3

Erv3, Endogenous retroviral sequence 3, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erv3Q9DAX3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Erv3Q9DAX3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Erv3Q9DAX3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms