Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Tmem239Q9DA47 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Tmem239Q9DA47 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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