Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Derl3Q9D8K3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms