Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fip1l1Q9D824 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Fip1l1Q9D824 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms