Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cldn22Q9D7U6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms