Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmigd1Q9D7L8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmigd1Q9D7L8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms