Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cldn23Q9D7D7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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Cldn23Q9D7D7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn23Q9D7D7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn23Q9D7D7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Cldn23Q9D7D7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn23Q9D7D7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn23Q9D7D7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn23Q9D7D7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn23Q9D7D7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn23Q9D7D7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn23Q9D7D7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn23Q9D7D7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn23Q9D7D7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn23Q9D7D7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn23Q9D7D7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn23Q9D7D7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn23Q9D7D7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn23Q9D7D7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn23Q9D7D7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn23Q9D7D7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn23Q9D7D7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn23Q9D7D7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn23Q9D7D7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn23Q9D7D7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn23Q9D7D7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn23Q9D7D7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn23Q9D7D7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn23Q9D7D7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn23Q9D7D7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cldn23Q9D7D7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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