Protein–RNA interactions for Protein: Q9D727

Uncharacterized protein C6orf226 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D727 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D727 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D727 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D727 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D727 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D727 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D727 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D727 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D727 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D727 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D727 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D727 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D727 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D727 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D727 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D727 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q9D727 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D727 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D727 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D727 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D727 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D727 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D727 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D727 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D727 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D727 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q9D727 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D727 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D727 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D727 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D727 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D727 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D727 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D727 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D727 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D727 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D727 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D727 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D727 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D727 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D727 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q9D727 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D727 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D727 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D727 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D727 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D727 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D727 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D727 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D727 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D727 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D727 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D727 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D727 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D727 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D727 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D727 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D727 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D727 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D727 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D727 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D727 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D727 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D727 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D727 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D727 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D727 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D727 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D727 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D727 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D727 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q9D727 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D727 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D727 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Q9D727 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D727 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D727 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D727 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D727 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D727 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D727 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D727 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D727 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D727 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D727 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D727 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D727 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D727 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D727 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D727 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D727 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D727 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D727 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D727 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D727 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D727 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D727 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q9D727 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D727 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q9D727 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms