Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc94Q9D6J3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms