Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc130Q9D516 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms