Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D4W2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D4W2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D4W2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D4W2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D4W2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D4W2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9D4W2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D4W2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9D4W2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9D4W2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms