Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ribc2Q9D4Q1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Ribc2Q9D4Q1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Ribc2Q9D4Q1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Ribc2Q9D4Q1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ribc2Q9D4Q1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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