Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
UvssaQ9D479 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UvssaQ9D479 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms