Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
4933428G20RikQ9D3X4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms