Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx20Q9D2Y5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms