Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F0

Rtl8b, CAAX box 1 homolog A (Human), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8bQ9D1F0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl8bQ9D1F0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl8bQ9D1F0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms