Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube2cQ9D1C1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube2cQ9D1C1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube2cQ9D1C1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube2cQ9D1C1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ube2cQ9D1C1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2cQ9D1C1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2cQ9D1C1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2cQ9D1C1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2cQ9D1C1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2cQ9D1C1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2cQ9D1C1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2cQ9D1C1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2cQ9D1C1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2cQ9D1C1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2cQ9D1C1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2cQ9D1C1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2cQ9D1C1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2cQ9D1C1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2cQ9D1C1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2cQ9D1C1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2cQ9D1C1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2cQ9D1C1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2cQ9D1C1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2cQ9D1C1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2cQ9D1C1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2cQ9D1C1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2cQ9D1C1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2cQ9D1C1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2cQ9D1C1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2cQ9D1C1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2cQ9D1C1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2cQ9D1C1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ube2cQ9D1C1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Ube2cQ9D1C1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Ube2cQ9D1C1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ube2cQ9D1C1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ube2cQ9D1C1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ube2cQ9D1C1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms