Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mrpl28Q9D1B9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl28Q9D1B9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms