Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3bQ9CZT8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab3bQ9CZT8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab3bQ9CZT8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab3bQ9CZT8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab3bQ9CZT8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3bQ9CZT8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3bQ9CZT8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3bQ9CZT8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3bQ9CZT8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3bQ9CZT8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3bQ9CZT8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3bQ9CZT8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3bQ9CZT8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3bQ9CZT8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3bQ9CZT8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3bQ9CZT8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3bQ9CZT8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3bQ9CZT8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3bQ9CZT8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3bQ9CZT8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3bQ9CZT8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3bQ9CZT8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3bQ9CZT8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3bQ9CZT8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3bQ9CZT8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3bQ9CZT8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms