Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Sgo1Q9CXH7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Sgo1Q9CXH7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Sgo1Q9CXH7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Sgo1Q9CXH7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Sgo1Q9CXH7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Sgo1Q9CXH7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgo1Q9CXH7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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