Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX47

Xrcc2, DNA repair protein XRCC2, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc2Q9CX47 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Xrcc2Q9CX47 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Xrcc2Q9CX47 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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