Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Yif1bQ9CX30 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms