Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWR2

Smyd3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd3Q9CWR2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smyd3Q9CWR2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Smyd3Q9CWR2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Smyd3Q9CWR2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Smyd3Q9CWR2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smyd3Q9CWR2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smyd3Q9CWR2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smyd3Q9CWR2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smyd3Q9CWR2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smyd3Q9CWR2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smyd3Q9CWR2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smyd3Q9CWR2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smyd3Q9CWR2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smyd3Q9CWR2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smyd3Q9CWR2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smyd3Q9CWR2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smyd3Q9CWR2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smyd3Q9CWR2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smyd3Q9CWR2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smyd3Q9CWR2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms