Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pfdn1Q9CWM4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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