Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atxn3Q9CVD2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms