Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Sycp2Q9CUU3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Sycp2Q9CUU3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Sycp2Q9CUU3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Sycp2Q9CUU3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Sycp2Q9CUU3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Sycp2Q9CUU3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Sycp2Q9CUU3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Sycp2Q9CUU3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms