Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rprd1bQ9CSU0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rprd1bQ9CSU0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms