Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRW3

UPF0538 protein C2orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRW3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CRW3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9CRW3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CRW3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Q9CRW3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms