Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA8

Exosc5, Exosome complex component RRP46, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc5Q9CRA8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Exosc5Q9CRA8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms