Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CR55 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CR55 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CR55 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CR55 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CR55 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CR55 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CR55 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CR55 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CR55 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CR55 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CR55 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CR55 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CR55 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CR55 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CR55 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CR55 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CR55 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CR55 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CR55 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CR55 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CR55 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CR55 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CR55 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CR55 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CR55 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CR55 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CR55 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CR55 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CR55 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CR55 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CR55 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CR55 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CR55 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CR55 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CR55 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CR55 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CR55 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CR55 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CR55 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CR55 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CR55 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CR55 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CR55 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CR55 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CR55 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CR55 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CR55 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CR55 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CR55 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CR55 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CR55 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CR55 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CR55 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CR55 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9CR55 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9CR55 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9CR55 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9CR55 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9CR55 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9CR55 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9CR55 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9CR55 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9CR55 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CR55 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CR55 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CR55 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CR55 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CR55 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CR55 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CR55 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CR55 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CR55 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CR55 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CR55 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CR55 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CR55 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CR55 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CR55 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CR55 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9CR55 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CR55 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CR55 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CR55 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CR55 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CR55 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CR55 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CR55 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CR55 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CR55 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CR55 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CR55 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CR55 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CR55 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CR55 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CR55 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CR55 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CR55 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CR55 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9CR55 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms