Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR52

4933400A11Rik, RIKEN cDNA 4933400A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933400A11RikQ9CR52 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4933400A11RikQ9CR52 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933400A11RikQ9CR52 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933400A11RikQ9CR52 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933400A11RikQ9CR52 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933400A11RikQ9CR52 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933400A11RikQ9CR52 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933400A11RikQ9CR52 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4933400A11RikQ9CR52 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933400A11RikQ9CR52 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933400A11RikQ9CR52 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933400A11RikQ9CR52 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933400A11RikQ9CR52 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4933400A11RikQ9CR52 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933400A11RikQ9CR52 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933400A11RikQ9CR52 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4933400A11RikQ9CR52 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933400A11RikQ9CR52 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933400A11RikQ9CR52 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933400A11RikQ9CR52 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933400A11RikQ9CR52 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933400A11RikQ9CR52 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933400A11RikQ9CR52 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933400A11RikQ9CR52 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933400A11RikQ9CR52 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933400A11RikQ9CR52 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4933400A11RikQ9CR52 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933400A11RikQ9CR52 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4933400A11RikQ9CR52 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms