Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ykt6Q9CQW1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms