Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rdm1Q9CQK3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rdm1Q9CQK3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms