Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Higd2aQ9CQJ1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms