Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nudt21Q9CQF3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nudt21Q9CQF3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms