Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Atp6v0e1Q9CQD8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Atp6v0e1Q9CQD8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Atp6v0e1Q9CQD8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Atp6v0e1Q9CQD8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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