Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chmp3Q9CQ10 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Chmp3Q9CQ10 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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