Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sike1Q9CPR7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sike1Q9CPR7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sike1Q9CPR7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sike1Q9CPR7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sike1Q9CPR7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sike1Q9CPR7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sike1Q9CPR7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sike1Q9CPR7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sike1Q9CPR7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sike1Q9CPR7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sike1Q9CPR7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sike1Q9CPR7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sike1Q9CPR7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sike1Q9CPR7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sike1Q9CPR7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sike1Q9CPR7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sike1Q9CPR7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sike1Q9CPR7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sike1Q9CPR7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sike1Q9CPR7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sike1Q9CPR7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sike1Q9CPR7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sike1Q9CPR7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sike1Q9CPR7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sike1Q9CPR7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sike1Q9CPR7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sike1Q9CPR7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sike1Q9CPR7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sike1Q9CPR7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sike1Q9CPR7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sike1Q9CPR7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms