Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930550L24RikQ99PA7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930550L24RikQ99PA7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930550L24RikQ99PA7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930550L24RikQ99PA7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930550L24RikQ99PA7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930550L24RikQ99PA7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930550L24RikQ99PA7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms