Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Rab27bQ99P58 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab27bQ99P58 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rab27bQ99P58 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rab27bQ99P58 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rab27bQ99P58 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rab27bQ99P58 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rab27bQ99P58 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rab27bQ99P58 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Rab27bQ99P58 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab27bQ99P58 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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