Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cep41Q99NF3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cep41Q99NF3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms