Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Mrpl3Q99N95 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Mrpl3Q99N95 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Mrpl3Q99N95 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Mrpl3Q99N95 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Mrpl3Q99N95 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Mrpl3Q99N95 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Mrpl3Q99N95 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Mrpl3Q99N95 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl3Q99N95 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl3Q99N95 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl3Q99N95 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl3Q99N95 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl3Q99N95 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl3Q99N95 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl3Q99N95 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl3Q99N95 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Mrpl3Q99N95 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Mrpl3Q99N95 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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