Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk5rap3Q99LM2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk5rap3Q99LM2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms