Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cstf3Q99LI7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cstf3Q99LI7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms