Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nmd3Q99L48 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms