Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Higd1bQ99JY6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Higd1bQ99JY6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Higd1bQ99JY6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms