Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TrabdQ99JY4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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TrabdQ99JY4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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TrabdQ99JY4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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TrabdQ99JY4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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TrabdQ99JY4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
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TrabdQ99JY4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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TrabdQ99JY4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TrabdQ99JY4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms